La región donde se localiza este Parque Nacional, fue poblada por los indios Quepoa, nombre que dio origen a la ciudad de Quepos. Con la llegada de los colonos, las tierras se convirtieron en áreas de cultivo, que posteriormente fueron adquiridas por la United Fruit Company.
El área que actualmente constituye el parque fue adquirida por extranjeros que impedían el acceso a los lugareños. Esa situación motivó la integración de un comité pro-parque nacional que convenció a las autoridades municipales y nacionales, para la declaración de éste como Parque Nacional.